引起月经不调的原因主要有以下几种，神经内分泌功能失调引起，主要是下后脑-生茶杯-卵巢轴的功能不稳定或是有缺陷，即月经病、器质病变或药物等引起。
出现月经不来的情况，也可以考虑几种原因，可能是压力引起，正值生育年龄的女性，如果长期处于压力下，会抑制脑下垂体的功能，使卵巢不再分泌女性荷尔蒙及不排卵，月经就会开始紊乱，同样，长期的心情压抑、生闷气或情绪不佳，也会影响到月经。
另外，女性也切忌贪凉，女性经期受寒，会使盆腔内的血管收缩，导致卵巢功能紊乱，可引起月经量过少，甚至闭经。
使用治疗精神病的药物，内分泌制剂或采取宫内节育器避孕者均可能发生月经不调。某些职业如长跑运动员容易出现闭经。此外，某些妊娠期异常出血也往往被误认为是月经不调。
合肥妇科医院专家称，滥用或经常大量使用抗生素，对女性而言可致月经失调、不排卵、闭经，这可能是药物抑制和伤害了人自身的抵抗力，导致了机体功能障碍。
