1、中国科学技术大学第一附属医院（安徽省立医院 ）(三甲医院)
安徽省立医院前身为合肥基督医院，始建于1898年，历经风雨洗礼，已发展成为一所设备先进、专科齐全、技术力量雄厚，集医疗、教学、科研、预防、保健、康复、急救为一体的省级大型三级甲等综合性医院，在最新一轮（2019年度）全国三级公立医院绩效考核中，跃居第24位，等级A+；在2019年度“复旦版中国医院排行榜”位居全国76位。医院目前由中国科学技术大学与安徽省卫生健康委员会双重管理，以中国科学技术大学管理为主。
安徽省立医院由总院(院本部)、南区（安徽省脑科医院、安徽省心血管病医院）、西区（安徽省肿瘤医院）、感染病院（合肥市传染病医院）和生殖与遗传分院组成，正在建设老年医学康复中心和北城医院。目前总占地面积（含规划面积）1158亩，总建成面积68.65万平方米，总在建面积(不含规划建筑面积）51.43万平方米。总编制床位2200张，开放床位5450张，设有47个临床医技学科。
安徽省立医院现有在职职工7141人，其中高级职称1013人。有特聘院士6人、国家级人才称号11人次、国务院及省政府津贴专家124人次、“江淮名医”49人次、省学术技术带头人47人及后备人选61人次，一级主任医师24人。
安徽省立医院现有国家临床重点专科建设项目6个，省临床重点专科21个,其中优先发展8个，重点专科10个，培育专科3个；安徽省“115”产业创新团队6支。
2、安徽医科大学第一附属医院 (三甲医院）
安徽医科大学第一附属医院是集医疗、教学、科研、预防、康复、急救为一体的大型综合性教学医院，为国家卫生应急医疗移动救治中心和安徽省紧急医疗救治基地。医院前身为上海东南医学院附属东南医院，创办于1926年。1949年内迁至安徽怀远县，1952年迁至合肥市。1993年成为卫生部首批三级甲等医院。医院连续十年入围中国最佳医院百强榜，综合实力稳居安徽省前茅。
目前，安徽医科大学第一附属医院共开放床位4990张，其中本部开放床位2825张，设临床科室41个，医技科室19个，临床教研室26个。年门诊量448.83万人次，年出院病人约20.40万人次，住院手术13.59万台次。高新院区占地面积200亩、开放床位2000张，配置安徽省首台专业医疗救援直升机，全面提升医院的危急重症移动救治处置能力。
安徽医科大学第一附属医院是临床医学一级学科科学和专业博士学位授权点，临床医学博士后科研流动站，硕士学位点覆盖所有的临床科室。拥有国家级重点学科1个，国家临床重点专科建设项目8个，安徽省临床重点专科建设项目26个。拥有国家重点实验室培育基地1个，教育部重点实验室1个，省部级共建重点实验室1个，省级重点实验室4个。医院拥有“疑难重症皮肤病协同创新中心”、“神经精神疾病与心理健康协同创新中心”省级协同创新平台，学科综合实力位列全球前1%。
安徽医科大学第一附属医院拥有博士生导师100余人，副高职称以上专家870余人，享受国务院和省政府特殊津贴120多人，全国"百千万人才工程"8人，全国“有突出贡献的中青年专家”8人，国家百千万工程领军人才1人，国家万人计划中组部青年拔尖人才1人，皖江学者3人，一级主任医师30人，省厅以上跨世纪学术技术带头人、骨干教师100余人，“江淮名医”44人，担任中华医学会、中国医师协会等省级以上医学学术团体负责人60多人，人才实力位居安徽省医疗机构第一。
3、安徽医科大学第二附属医院 (三甲医院)
安徽医科大学第二附属医院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复等多功能于一体的非营利性、三级甲等现代化综合性教学医院。医院于2008年开诊，2013年率先在安徽省按照原卫生部部颁标准通过国家三级医院等级评审。2017年初，医院以高分通过JCI（Joint Commission International, 医疗机构评审联合委员会国际部）评审，成为安徽省首家获得JCI认证、全国第十家以学术型医学中心医院通过JCI评审的大型公立医院。医院在2018年度首次全国三级公立医院绩效考核监测排名中获A+，跻身全国百强行列。在2019年中国医院科技量值与中国医学院校科技量值排名中，6个学科进入全国前100位，总体科技百强学科数量位居全省前三。
安徽医科大学第二附属医院位于合肥市经济技术开发区、高新技术开发区和政务文化新区交汇处，总建筑面积281668平方米，目前开放床位2300余张。院内以连廊及科学的流线设计将医用、人流、物流科学分开，配以现代医用净化空调、全面集成数字化信息系统、完善的生活休闲服务设施和大面积休闲绿地，共同构筑了一座花园式、人性化的大型医院，2018年被评为首届中国最美医院。
安徽医科大学第二附属医院现有在职员工2427人，其中高级职称317人、博士171人、博导35人、硕导155人,享受国务院特殊津贴2人、省政府特殊津贴4人,国家卫生计生突贡中青年专家1人,省学术技术带头人及后备人选16人,江淮名医7人,皖江学者特聘教授1人,青年皖江学者2人,省卫生系统青年领军人才9人,省级学术团体主任委员27人次、副主任委员167人次,国家级学术团体副主任委员11人次、常委34人次。
4、安徽中医药大学第一附属医院（安徽省中医院 ）(三甲医院)
安徽中医药大学第一附属医院（安徽省中医院、安徽中医药大学第一临床医学院）是安徽省规模最大的综合性“三级甲等”中医医院，承担着全省中医药医疗、教学、科研、预防和保健的重要任务，是培养中医药临床人才的摇篮，是国家中医临床研究基地、国家中医药传承创新项目建设单位、国家区域中医（专科）诊疗中心，是我省干部保健定点医疗机构。
安徽中医药大学第一附属医院创建于1959年，占地面积6.6万平方米，建筑面积16万平方米，开放床位2100张，固定资产8.25亿元，拥有高级专业技术职称人员438人，博士、硕士研究生导师115人，博士、硕士研究生575余人，享受国务院及省政府特殊津贴20人，国医大师2人、首届全国名中医2人，国家中医药领军人才支持计划—岐黄学者1人，全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师19人，全国优秀中医临床人才研修项目培养对象14人，全国中药特色技术传承人才培训项目培养对象6人，安徽省江淮名医20人，安徽省国医名师9人，安徽省名中医34人，安徽省学术和技术带头人及后备人选11人，省教育厅、卫生厅学术带头人及骨干教师17人，医院名老中医和特色专家15人，医院优秀中青年学科带头人17人，拥有临床科室49个，医技科室12个，临床教研室18个。拥有特需诊疗服务中心（国际医疗部）、传统疗法中心、治未病中心和名医堂等多个诊疗服务中心；拥有国家区域中医（专科）诊疗中心3个，安徽省115产业创新团队3个，国家临床重点专科6个，国家中医药管理局重点学科9个，国家中医药管理局重点专科、专病12个，安徽省重点专科18个，院内重点专病106个。
国家中医药管理局三级实验室3个，重点研究室1个，9个临床学科拥有硕士学位授予权。拥有国医大师工作室2个，全国名中医传承工作室2个，国家级名老中医传承工作室13个、安徽省名老中医工作室27个、全国中医学术流派传承工作室2个。
5、合肥市第一人民集团医院 (三甲医院)
合肥市第一人民集团医院始建于1952年，1954年正式开诊。是一所集医疗、教学、科研、保健、预防、康复、急救、健康检查、临终关怀为一体的大型三级甲等综合性医院。2006年经安徽省政府批准成为安徽医科大学第三附属医院。按照“集团化发展、集约化管理、集束化执行、集成化运营”的发展思路，从院本部单体发展成为拥有2个三级甲等医院（合肥市第一人民医院本部、合肥市滨湖医院）和1个三级甲等医院延伸院区（合肥市第一人民医院西区）,3所专科分院（庐阳康复分院、医学美容分院、公安监管分院），三个门诊部（琥珀门诊部、政务中心门诊部、市委门诊部）的集团医院。医院占地面积360亩，医疗建筑面积40万平方米，床位4965张，总资产36亿元。职工3536人，其中卫生专业技术人员3049人，占员工总数86.2%。在编1201人（自建池735人，周转池466人），编外聘用2335人。年门急诊量260余万人次，年住院量约17万人次，年手术量约4万余台次，总收入23.8亿元。荣登艾力彼医院管理研究中心2018年省域医院30强榜单安徽省第四名，2019年全国省单医院100强排名第三十五名，已成为安徽省地市级医院的领军。
合肥市第一人民集团医院拥有高级职称437人，其中正高职称85人，副高职称352人。汇集65名博士成立“博士联盟”，585名硕士成立“硕士沙龙”。博士生导师1人，硕士生导师38人，年培养硕、博士130余人。医养结合团队获批第十三批"115"产业创新团队，拥有安徽省江淮名医2人，合肥市“名医工作室”领衔人19人。4人获评合肥市专业技术拔尖人才，1人获评安徽省学术和技术带头人后备人选，4人获评合肥市学术和技术带头人”。一批年富力强、富于创新精神的中青年学科带头人和技术骨干逐渐崭露头角。2020年，30博士、18名正高职称竞聘到临床科室担任学科带头人和行政负责人。
合肥市第一人民集团医院专科门类齐全，按照国际四级分科，现拥有45个临床学科、18个医技学科，100余个临床病区和32个医技科室。近年来，医院累计获批省级重点学科建设系列21批次;累计获批市级重点学科建设系列54批次;现拥有国家临床重点专科1个、省“十三五”重点专科1个、重点培育专科1个、中医重点专科2个，合肥市第五周期重点专科8个、重点培育专科2个、特色专科4个，合肥市中医重点专科1个，安医大重点学科2个、重点扶持学科1个。
6、安徽省第二人民医院 (三甲医院)
安徽省第二人民医院座落于省会合肥市，是安徽省卫健委直属的三级甲等综合性医院。挂设安徽省职业病防治院、安徽省眼科医院（中古友谊眼科医院）。现为安徽医科大学临床学院、安徽医专附属医院。医院现占地面积206亩，开放床位近2000张，设有52个临床科室，27个医技科室。全院在职员工2000余人，高中级职称800余人,博士、硕士学历600余人。
安徽省第二人民医院目前拥有8个省级临床重点专科，是安徽省危重孕产妇救治中心、安徽省危重新生儿救治中心、安徽省职业健康检查质量控制中心、安徽省核辐射紧急医学救援基地、安徽省全科医学师资培训基地、国家医师资格实践技能考试（公共卫生类）基地、国家级住院医师规范化培训基地。拥有高能直线加速器、3.0T核磁共振、256排CT、DSA、四维彩超等大型医疗设备。是全国“五一劳动奖状”获奖单位、全国医药卫生系统先进集体、全国百姓放心示范医院、安徽省诚信医院。
7、合肥市第二人民医院 (三甲医院)
合肥市第二人民医院始建于1950年，前身为中国人民志愿军521野战医院，历经六十多年的发展，已成为合肥市东区规模最大的集医疗、科研、教学、预防、保健、康复、急救等为一体的综合性三级甲等医院，是安徽医科大学附属合肥医院。
合肥市第二人民医院总占地面积200余亩，含三个院区，下辖2个社区卫生服务中心及瑶海区13家紧密型医联体单位。获批合肥市“十三五”规划医养结合老年护理院项目，规划床位1000张，目前，拥有床位3016张，开放床位2441张，职工2317人，卫生技术人员2105人。高级职称203人，研究生导师75人，教授、副教授107人。博士及在职博士45人，硕士460人。研究生培养点28个。
合肥市第二人民医院拥有临床学科30个、医技学科11个、GCP专业12个、市质控中心19个、市医学分会23个，省重点学科2个、市重点学科14个、安医大重点学科1个、院级重点学科16个，50万元以上大型设备100余台/套。拥有临床学科26个、医技学科10个、临床研究室6个
8、复旦大学附属儿科医院安徽医院（安徽省儿童医院）（三甲医院）
复旦大学附属儿科医院安徽医院（安徽省儿童医院）是国家发展改革委员会批准的第一批国家区域医疗中心建设试点单位，由安徽省政府和复旦大学附属儿科医院依托安徽省儿童医院合作共建，为政府举办的公益性医疗机构。分本部和新院两个院区。目前，医院是国家发展改革委、国家卫生健康委首批 “国家区域医疗中心”试点建设项目，发展目标是建成集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的国内一流、省内领先的儿童专科医院。医院秉承“一切为了孩子”的服务理念，努力为儿童提供安全、有效、方便、价廉的医疗卫生服务。
安徽省儿童医院位于望江路39号,占地面积3.66万平方米，拥有医疗用房面积6.4万平方米。2019年门诊量121万人次，出院患儿近8万人次，年住院手术2万余台次，医疗设备总值28350万元。目前编制床位1350张，现有职工1974人，卫生技术人员1534名，高级职称181人，博硕士400人。医院拥有全国一流带环境体验核磁共振、螺旋CT等现代化的医疗、科研设备。隶属安徽省卫生健康委，是安徽唯一一所大型综合性三级甲等儿童专科医院。现为安徽省儿童医疗协会会长单位、安徽省儿科专业质控中心主任单位、安徽省新生儿急救中心和随访干预中心、安徽省儿童急救中心、北京儿童医院集团首批成员单位、长三角地区儿童医疗联盟共同发起单位；是安徽省儿科医学研究所所在单位、安徽医科大学附属省儿童医院、安徽省儿童健康与疾病临床医学研究中心、第十批省级博士后科研工作站（博士后创新实践基地）、国家级住院医师规范化培训基地、国家级新生儿围产期医学专业专科医师规范化培训基地；是全省儿科重症监护专科护士培训基地、全省妇幼医护培训基地、新生儿内科培训基地等。
9、安徽省妇幼保健院 (三甲医院)
安徽省妇幼保健院始建于1951年，是一所集医疗、教学、科研、保健于一体的三级甲等专科医院，担负着安徽省内妇科疾病诊治、高危妊娠处理、助产分娩、辅助生育、计划生育手术、妇幼保健、新生儿疾病治疗、乳腺病诊治等医疗保健的重要任务。
目前安徽省妇幼保健院拥有中心院区、东院（合肥市第五人民医院、合肥市儿童医院）、西院（国际妇女儿童医学中心）、南院(建设中)、临泉分院、泗县分院七大院区，总建筑面积35万平方米，各院区建成后我院将成为体量位居全国前列的妇幼保健院。现有在岗职工1800多名，目前实际开放床位1450张。
安徽省妇幼保健院以技术力量雄厚、特色专科突出、多学科综合优势强大享誉省内外，以精益求精的技术和全面优质的服务，赢得了广大孕产妇和患者信赖。2019年全年全院门急诊量达132万人次，分娩量3.1万人次。
10、安徽中医药大学第二附属医院（安徽省针灸医院） (三甲医院)
安徽省针灸医院、安徽中医药大学第二附属医院创建于1985年，是全国最早成立、目前也是全国规模最大的集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的三级甲等针灸专科医院，是国家中医药管理局“中医药国际合作基地”、世界针灸学会联合会“临床基地”、国家中医药管理局“中医药标准化研究推广基地”、中国针灸学会“针灸标准化研究示范基地”、安徽省针灸临床国际联合研究中心，安徽省特色中医院，内设安徽省中医药科学院针灸临床研究所。
安徽中医药大学第二附属医院占地面积18790平方米，建筑面积51500平方米，设有28个临床科室，开放病区25个，医技科室9个，开放床位1016张。医院现有在岗职工906人，高级职称107人。拥有全国名老中医学术经验继承导师6人，名老中医学术经验继承人32人，全国中医药优秀临床人才3人；博士生导师7人，硕士生导师55人；全国名中医1人，江淮名医12人，安徽省国医名师3人，安徽省名中医16人，省政府津贴1人，省学术技术带头人1人、后备人选2人，全国中医优秀临床人才5人，全国中药特色技术人才1人，全国中医药创新骨干人才、西学中骨干人才、中医临床技术特色骨干共计5人，安徽省中医药领军人才4人；国家级临床重点专科带头人3人，国家局“十三五”重点专科带头人8人，全国中药特色技术人才1人，省级临床重点专科带头人10人，省级临床重点专病带头人3人。
安徽中医药大学第二附属医院设有脑病、骨伤、推拿、脾胃、老年病、康复、心内、内分泌、呼吸、肿瘤、皮肤、肛肠、妇、男、儿、外、五官、眼、口腔、急诊、麻醉、重症等临床科室及治未病中心。拥有国家重点学科2个，国家临床重点专科3个，国家中管局重点专科 8个，安徽省中医药管理局重点专科7个、重点专病3个，国家名中医工作室4个，省名中医工作室13个。医院拥有核磁共振成像系统、多层螺旋CT、全自动生化分析仪等先进大型医疗仪器设备16台。拥有中医体质辨识系统、中药煎药包装机、中药制剂设备、中医推拿康复理疗设备等。
